http://www.sixapart.jp/movabletype/news/2008/08/20-1918.html
MT4.1x とカスタムフィールドをお使いの場合は MT4.2 へのアップグレードはおまちください
Movable Type 4.1x をお使いで、カスタムフィールドを利用している場合、4.2 へアップグレードは行わないでください。
MT4.1x から MT4.2 にアップグレードを行う際、カスタムフィールドのデータを一部消失する可能性があるためです。
やっぱり…。RC版のときにカスタムフィールドの値が消えてしまっていたので、あわてて4.1に戻したことがあったが…。(ちゃんとバックアップ取ってあってよかった。)正式版が出た後に恐る恐る4.2にアップしたけど、そのときは(一見)カスタムフィールドの値は消えていなかった。だから安心して4.2で稼動しているのだが…。ひょっとしたら、気づいていないところの値が消えているのかも…。